Z ogromn膮 rado艣ci膮 informujemy o pomy艣lnym zako艅czeniu wyj膮tkowych, trzydniowych warsztat贸w szkoleniowych pt. 鈥濨arcoding with ONTOLOGY: a barcoding lab start鈥�, kt贸re odby艂y si臋 na Wydziale Biologii Uniwersytetu Szczeci艅skiego.
Szkolenie, kt贸re poprowadzi艂 koordynator krajowy inicjatywy PolBOL, dr hab. Tomasz Mamos, prof. U艁, mia艂o na celu praktyczne wdro偶enie nowoczesnych metod sekwencjonowania nanoporowego (ONT) w codziennej pracy badawczej biolog贸w zajmuj膮cych si臋 r贸偶norodno艣ci膮 biologiczn膮.
Od pipety do analizy bioinformatycznej
Kameralna, 5-osobowa grupa uczestnik贸w przesz艂a pe艂n膮, intensywn膮 艣cie偶k臋 laboratoryjn膮:
- Lab Start i sterylno艣膰: Uczestnicy poznali kluczowe zasady czysto艣ci i bezpiecze艅stwa w laboratorium molekularnym, niezb臋dne przy pracy z czu艂ymi technologiami high-throughput.
- Hardware w praktyce: Warsztaty obj臋艂y mistrzowskie opanowanie codziennego sprz臋tu 鈥� od kalibracji pipet, przez vortexy i wir贸wki, a偶 po precyzyjn膮 fluorometryczn膮 kwantyfikacj臋 DNA systemem Qubit.
- Sekwencjonowanie ONT: G艂贸wnym punktem programu by艂o samodzielne przygotowanie bibliotek oraz uruchomienie i monitorowanie procesu sekwencjonowania na przeno艣nym urz膮dzeniu MinION Mk1D.
- Analiza danych: Szkolenie zamkn臋艂o wprowadzenie do wst臋pnej analizy bioinformatycznej oraz pracy z platform膮 ONTOLOGY zintegrowan膮 z baz膮 danych BOLD.
Innowacje i perspektywy na przysz艂o艣膰
Uczestnicy warsztat贸w 鈥� biolodzy, kt贸rzy nie posiadali wcze艣niej g艂臋bokiego do艣wiadczenia w zaawansowanych procedurach molekularnych 鈥� niezwykle entuzjastycznie ocenili intuicyjno艣膰 i mo偶liwo艣ci systemu ONTOLOGY.
Wnioski z dyskusji pozycjonuj膮 PolBOL jako kluczowy hub technologiczny w kraju. Cz臋艣膰 badaczy planuje samodzielne wdro偶enie pe艂nego protoko艂u w swoich laboratoriach, natomiast dla pozosta艂ych optymalnym rozwi膮zaniem na przysz艂o艣膰 b臋dzie model hybrydowy. Narodzi艂 si臋 z tego 艣wietny plan: regularne konsolidowanie z艂膮czy (pooli) pr贸bek z r贸偶nych o艣rodk贸w w Polsce i wsp贸lne sekwencjonowanie ich na jednej kom贸rce przep艂ywowej (flow cell) MinION w laboratorium prof. Mamosa.
Mi臋dzynarodowa wsp贸艂praca i finansowanie
Wydarzenie to doskona艂y przyk艂ad synergii nauki polskiej i mi臋dzynarodowej. System ONTOLOGY rozwijany jest we wsp贸艂pracy z zespo艂em prof. Kena Thompsona (University of Guelph, Kanada), a same warsztaty stanowi膮 cz臋艣膰 integracji w ramach europejskiej sieci doskona艂o艣ci.
Wydarzenie zosta艂o zrealizowane w ramach projektu Biodiversity Genomics Europe Plus (BGE+) finansowanego z programu ramowego Unii Europejskiej 鈥濰oryzont Europa鈥� oraz wsp贸艂finansowane przez Ministra Nauki w ramach programu 鈥濺egionalna Inicjatywa Doskona艂o艣ci鈥� na lata 2024鈥�2027 (RID/SP/0045/2024/01) dla Wydzia艂u Biologii i Ochrony 艢rodowiska Uniwersytetu 艁贸dzkiego.
Serdecznie dzi臋kujemy Wydzia艂owi Biologii Uniwersytetu Szczeci艅skiego za go艣cin臋, a uczestnikom za wspania艂膮 atmosfer臋 i motywacj臋 do pracy! Kolejne kroki to zaplanowane ju偶 spotkanie online, podczas kt贸rego przetestujemy najnowszy, dedykowany systemowi Windows build oprogramowania ONTOLOGY.
Instytucja odpowiedzialna
Wsp贸艂finansowane przez Ministra Nauki w ramach Programu 鈥濺egionalna Inicjatywa Doskona艂o艣ci鈥� na lata 2024鈥�2027 (RID/SP/0045/2024/01).
